Le Shiatsu prend sa source dans la tradition millénaire de la médecine orientale.

Le premier ouvrage de Médecine traditionnelle chinoise (vers 100 avant JC) serait à l’origine de cette technique, avec notamment la stimulation des points d’énergies.

Influencée par le Taoïsme et le Confucianisme, cette technique fut enseignée par les moines bouddhistes avant de se propager dans toute l’Asie. Elle s’implanta particulièrement au Japon vers le VII ème siècle où elle fut pratiquée sous le nom de l’Anmo/Anma.

Du fait du gouvernement de l’époque, la discipline déclina progressivement avant de refaire son apparition. C’est en 1955 que cette pratique prit le nom de Shiatsu (pression des doigts) et fut reconnue officiellement par le Ministère japonais de la Santé comme une médecine à part entière.

En 1970, le Shiatsu fit son apparition en France et en Europe, notamment grâce aux maîtres Y.Kawada et S.Masunaga et en 1994 fut créé la Fédération Française de Shiatsu Traditionnelle (FFST).

Le Shiatsu est une des 8 approches alternatives désignées, dans la résolution du Parlement Européen votée le 29 mai 1997, en tant que « médecine non conventionnelle digne d’intérêt ». Cette résolution a amené la reconnaissance de l'ostéopathie, de la chiropraxie et de l'homéopathie dans certains pays d'Europe.